1973年、ベトナム。ひとりのアメリカ人兵士が”バナナフィッシュ”という言葉を残し、突然精神をきたしたのだ・・・

1985年、ニューヨーク。謎の言葉”バナナフィッシュ”を追うアッシュに、暗黒街のボス、パパ・ディノの黒い影が迫る！！

アッシュを助けようとして、マービンに射殺されたスキップ！怒るアッシュは、逃げるマービンを追って彼の部屋へ・・・。

しかしマービンはすでに何者かに殺されており、なぜか死体のそばにアッシュの銃が・・・！！罠にはまったアッシュは！？

アッシュの兄、グリフが死んだ・・・獄中でそれを知ったアッシュは、保釈されたその日、エイジと共にみんなの前から姿を消してしまう。アッシュの標的は、兄を殺したパパ・ディノ！！息を殺してアッシュは対決の時間を待っていた・・・。

1985年、ニューヨーク。謎の言葉”バナナフィッシュ”を追うアッシュに、暗黒街のボス、パパ・ディノの黒い影が迫る！！

アッシュを追って、パパ・ディノの魔手がケープゴッドまでのびてきた。

アッシュたちはその手をのがれるため、またグリフの残した「バナナ フィッシュ」の手がかりを追うために、一路L・Aへ向かった。しかし、そこにも新たな敵が！

ユーシスは、手下にマックスの家族を襲わせ、アッシュをおびきだしたすきに英二を拉致した！！

怒るアッシュだったが、その時、家に隠れていたドースン博士を発見！！彼こそ、あのバナナフィッシュの全てを知る、唯一の人間だったのだ！！

BANANA FISHの実験台にされたショーターは、英二を見て襲いかかった！アッシュの必死の呼びかけで一瞬正気を取り戻し、ショーターは自分を殺してくれとアッシュに頼むのだった。

アッシュの銃弾がショーターの胸を貫いた！

マンハッタンで英二と共に束の間の休息をとるアッシュ。しかし、その間にもオーサーたちは血なまこになってアッシュを捜している。ディノの計略により、アッシュは警察からも追われる身となった。アッシュの反撃なるか・・・！？

オーサーの手下を次つぎと倒してゆくアッシュ。アッシュの隠れ家をつきとめることができず、あせるオーサーは、アッシュに一対一の勝負を申し込んだ。アッシュは罠と知りながら、勝負に応じたが・・・！？

ついにアッシュとオーサーの1対1の勝負が始まった。

ニューヨーク中の不良少年たちと英二が見守る中で、アッシュはついにオーサーを倒した。しかし、アッシュは自らも重傷を負い、さわぎに駆け付けた警察に捕らわれてしまった！？

アッシュの死亡のニュースが流れる中、英二はユーシスを人質にとり、チャイニーズ・マフィアのもとから脱出に成功する。ユーシスは、もしアッシュが生きていたら、自分はアッシュの敵になると英二に宣言した。英二はユーシスに銃を向けるが・・・！？

精神衛生センターの最高警備システムをかいくぐって、アッシュの逃走劇はつづく。ザハレフ男爵はアッシュを発見しだい射殺の命令をくだした。一方、センターに潜入したマックスと伊部は、ガードマンにつかまってしまい・・・！？

アッシュは、バナナフィッシュをめぐる陰謀について問いただそうと、上院議員キッパードのいるアパートを訪れる。

しかし、そのアッシュの目の前で、キッパードは額を撃ち抜かれて死んだ。殺し屋”白～ブランカ～”が動いていることをアッシュはまだ知らない・・・！？

ディノと月龍（ユエルン）は結託し、アッシュを追い詰めるため、英二にターゲットを定め超一流のプロ、ブランカに英二を狙わせる。英二だけは傷つけまいと願うアッシュは、ディノたちの要求に従い、ドースン博士らを拉致。さらにBANANA FISHの情報をも入手すべく動き出した・・・！？

英二とシンたちは、アッシュ救済の計画を練り始めるが、その頃ディノはアッシュの養子縁組の手続きを済ましてしまう。

一方月龍も、ブランカと契約し、アッシュを逃さないための手が着々と進められる。抵抗するすべのないアッシュは、ますます衰退してゆくが・・・！？

アッシュは、シンたちの手引きで地下の下水道に潜った。しかし、逃亡する時おとりになった英二たちは次第に追い詰められてゆく。英二の命を守るため、アッシュは逆に自らに追手の目を引きつけ、自然博物館にたてこもった。だが、そのころ既に英二は月龍の部下たちに捕らえられ…！？

パパ・ディノや月龍一派の追跡を辛うじて振り切ったアッシュ。だがディノはすでに新たな刺客を用意していた。今度の相手、フォックスとその部下達はプロの傭兵部隊！これまでとは全く違う強敵を相手に、アッシュはストリートキッズ達を率いて立ち向かう！！

フォックスに人質をとられ、投降したアッシュ。その彼に、フォックスは２人でコルシカ人財団を乗っ取ることを提案。

そしてそのために、財団が合衆国政府の中枢部と共有している秘密を明かすようアッシュに迫る。フォックスの野心を知り、アッシュは・・・！？

フォックスに捕えられた仲間を救出するため、国立精神衛生センター襲撃を企てるアッシュ達。勝ち目の薄い戦いに立ち向かうアッシュに、ブランカは月龍との契約を打ち切り、協力を申し出る。彼の手引きで英二の病室を訪れたアッシュは、決選の場へと向かうが・・・！？

戦いは終わった。パパ・ディノは炎の中に消え、ブランカはカリブへと去った。すべては時の彼方へと過ぎ去り、生き残った者たちには平穏な日々がもたらされようとしていた。英二の退院、そして帰国の日が近づいてくる。しかし、彼との別れを決意したアッシュは・・！？